I tillegg til de to seilfartøyene "Anna" af Sand og "Wyvern" består Sjøfartsmuseets samlinger av:
- 4 åpne bruksbåter fra Rogaland
- Ca. 7.000 gjenstander, for det meste modeller, arbeidsredskaper og utstyr fra handelssjøfart og andre maritime næringer, men også marinarkeologisk funnmateriale
- Ca. 150 malerier, vesentlig skipsportretter
- Ca. 600 kart
- Ca. 15.000 foto
- Et omfattende tegningsarkiv fra lokale skipsverft, Stavanger Støberi & Dok og Rosenberg Mekaniske Verksted
- En rekke privatarkiver fra lokale maritime virksomheter
- Tematiske kortkataloger, klipparkiv og saksarkiver