Siden 1987 har Stavanger Museum vært nasjonal sentral for den vitenskapelige ringmerkingsvirksomheten i Norge, og før det, en av to sentraler. Dette har naturlig nok preget forskningsvirksomhet ved avdelingen. I samarbeid med Universitetets Naturhistoriske Museer og Botaniske Hage – Universitetet i Oslo, og Høgskolen i Lillehammer, blir resultatet av ringmerkingsvirksomheten i Norge presentert i bokverket "Norsk RingmerkingsAtlas". Første bind ble publisert i 2003, og det siste i 2006.

I perioden 1951-1987 utga museet det zoologiske tidsskriftet Sterna, hovedsakelig med ornitologiske artikler.  Klikk her>> for å se artiklene i tidsskriftet.

Ved avdelingens fuglestasjon på Reve i Klepp kommune drives det langsiktige prosjekter med følgende formål

· bestandsendringer

· biometri hos utvalgte arter

· registrering av trekkforløpet

.